결장암의 대부분을 차지하는 것은 선암입니다. 결장선암은 결장 벽의 가장 안쪽 층인 점막층에서 발생하며, 진행할수록 점막하층으로 침윤되고 점막하층을 지나 근육층 및 그 이상의 단계로 진행하게 됩니다. 선암의 대부분은 선종이라는 양성 종양(폴립, 용종)이 진행되어 발생합니다.
선암 이외에도 림프종, 육종, 신경 내분비종(유암종) 등이 발생할 수 있습니다.